Kloonisotilaskomentajat olivat kloonisotilaita, jotka kasvatettiin Kaminolla Tasavallan suurarmeijan riveihin johtajanrooleihin erityiskoulutuksella. Heidän geeneihinsä oli siis lisätty enemmän itsenäisyyttä ja johtajuutta. Kloonikomentajaa alempi arvo oli kloonisotilaskapteeni.
Kloonisotilaskomentajat olivat kloonisotilaita, jotka kasvatettiin Kaminolla Tasavallan suurarmeijan riveihin johtajanrooleihin erityiskoulutuksella. Heidän geeneihinsä oli siis lisätty enemmän itsenäisyyttä ja johtajuutta. He johtivat kukin 2304 kloonisotilaan rykmenttiä taistelussa. Kullakin kloonisotilaslegioonalla oli vain yksi seniorikloonikomentaja. Kuitenkin joskus pienempiä patalioonia ja rykmenttejä johti kloonikomentaja, kuten Cody johti 212. hyökkäyspatalioonaa. Kun jedit tarvitsivat ryhmän kloonisotilaita, ei väliä minkä kokoisen, kloonikomentaja tavallisesti liittyisi joukkoon avustamaan jedikenraaleja. Kloonikomentajaa alempi arvo oli kloonisotilaskapteeni.